MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019738	ACC	2	6	59550	59555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308425
1002	NC_019738	TTCT	2	8	59620	59627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_019738	AAT	2	6	59648	59653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019738	CCA	2	6	59693	59698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_019738	CTT	2	6	59740	59745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019738	T	6	6	59744	59749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019738	CTT	2	6	59754	59759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019738	T	6	6	59758	59763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019738	CTT	2	6	59768	59773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019738	TGA	2	6	59801	59806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019738	AAT	2	6	59871	59876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019738	CAAT	2	8	59918	59925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_019738	AAC	2	6	59957	59962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308426
1014	NC_019738	CAA	2	6	60010	60015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308426
1015	NC_019738	ATT	2	6	60044	60049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308426
1016	NC_019738	T	6	6	60140	60145	0 %	100 %	0 %	0 %	428308426
1017	NC_019738	CAA	2	6	60233	60238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308426
1018	NC_019738	ATTT	2	8	60265	60272	25 %	75 %	0 %	0 %	428308426
1019	NC_019738	ACA	2	6	60282	60287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308426
1020	NC_019738	CAA	2	6	60310	60315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308426
1021	NC_019738	CCG	2	6	60339	60344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308426
1022	NC_019738	TCA	2	6	60622	60627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308426
1023	NC_019738	CGC	2	6	60726	60731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_019738	TAAT	2	8	60734	60741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019738	CTA	2	6	60742	60747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019738	TC	3	6	60760	60765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_019738	A	6	6	60911	60916	100 %	0 %	0 %	0 %	428308427
1028	NC_019738	TAT	2	6	60935	60940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308427
1029	NC_019738	ATT	2	6	60946	60951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308427
1030	NC_019738	TAT	2	6	60977	60982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308427
1031	NC_019738	TGG	2	6	61027	61032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308427
1032	NC_019738	ATT	2	6	61090	61095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308427
1033	NC_019738	GTG	2	6	61154	61159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308427
1034	NC_019738	ATT	2	6	61183	61188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308427
1035	NC_019738	TCT	2	6	61224	61229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308427
1036	NC_019738	A	6	6	61328	61333	100 %	0 %	0 %	0 %	428308427
1037	NC_019738	GAT	2	6	61392	61397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308427
1038	NC_019738	TTTTA	2	10	61398	61407	20 %	80 %	0 %	0 %	428308427
1039	NC_019738	ATC	2	6	61592	61597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308427
1040	NC_019738	TCA	2	6	61688	61693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308427
1041	NC_019738	CTG	2	6	61714	61719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308427
1042	NC_019738	A	6	6	61753	61758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019738	TC	3	6	61797	61802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_019738	TGCAC	2	10	61876	61885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1045	NC_019738	GAA	2	6	61898	61903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019738	TGAG	2	8	61909	61916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019738	ACA	2	6	61918	61923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019738	TGC	2	6	62032	62037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308428
1049	NC_019738	TGT	2	6	62038	62043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308428
1050	NC_019738	ACG	2	6	62083	62088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308428
1051	NC_019738	AGG	2	6	62092	62097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308428
1052	NC_019738	TTC	3	9	62125	62133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308428
1053	NC_019738	TTG	2	6	62137	62142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308428
1054	NC_019738	CT	3	6	62183	62188	0 %	50 %	0 %	50 %	428308428
1055	NC_019738	CTT	3	9	62358	62366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308428
1056	NC_019738	CAAA	2	8	62425	62432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_019738	GGAT	2	8	62463	62470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019738	TAA	2	6	62544	62549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019738	TA	3	6	62561	62566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019738	ATT	2	6	62653	62658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019738	ACAG	2	8	62716	62723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_019738	GA	3	6	62781	62786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019738	AGC	2	6	62939	62944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019738	GAG	2	6	63094	63099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019738	GAA	2	6	63104	63109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019738	CT	3	6	63249	63254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_019738	A	6	6	63279	63284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019738	GA	3	6	63297	63302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019738	TCCG	2	8	63307	63314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_019738	ACT	2	6	63405	63410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_019738	ATT	2	6	63426	63431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019738	TGT	2	6	63451	63456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019738	GAC	2	6	63506	63511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019738	ATT	2	6	63565	63570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019738	CAA	2	6	63597	63602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019738	AG	3	6	63824	63829	50 %	0 %	50 %	0 %	428308429
1077	NC_019738	TACC	2	8	63833	63840	25 %	25 %	0 %	50 %	428308429
1078	NC_019738	CTGA	2	8	63900	63907	25 %	25 %	25 %	25 %	428308429
1079	NC_019738	GCT	2	6	63931	63936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308429
1080	NC_019738	AGA	2	6	63953	63958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1081	NC_019738	CAA	2	6	63997	64002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308429
1082	NC_019738	TTA	2	6	64039	64044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308429
1083	NC_019738	AAT	2	6	64053	64058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308429
1084	NC_019738	AAG	2	6	64087	64092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1085	NC_019738	AT	3	6	64100	64105	50 %	50 %	0 %	0 %	428308429
1086	NC_019738	TGA	2	6	64109	64114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308429
1087	NC_019738	AGA	2	6	64133	64138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1088	NC_019738	AGA	2	6	64169	64174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1089	NC_019738	GA	3	6	64208	64213	50 %	0 %	50 %	0 %	428308429
1090	NC_019738	CCA	2	6	64273	64278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308429
1091	NC_019738	ATA	2	6	64330	64335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308429
1092	NC_019738	ATT	2	6	64343	64348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308429
1093	NC_019738	CTTT	2	8	64383	64390	0 %	75 %	0 %	25 %	428308429
1094	NC_019738	TGA	2	6	64391	64396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308429
1095	NC_019738	AGA	2	6	64424	64429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1096	NC_019738	TGA	2	6	64498	64503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308429
1097	NC_019738	GTT	2	6	64592	64597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308429
1098	NC_019738	CGG	2	6	64609	64614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308429
1099	NC_019738	TTGA	2	8	64767	64774	25 %	50 %	25 %	0 %	428308429
1100	NC_019738	CAGC	2	8	64915	64922	25 %	0 %	25 %	50 %	428308429
1101	NC_019738	AAG	3	9	65082	65090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1102	NC_019738	TG	3	6	65112	65117	0 %	50 %	50 %	0 %	428308429
1103	NC_019738	GTTT	2	8	65165	65172	0 %	75 %	25 %	0 %	428308429
1104	NC_019738	TCG	2	6	65240	65245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308429
1105	NC_019738	GGC	2	6	65291	65296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308429
1106	NC_019738	ATA	2	6	65335	65340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308429
1107	NC_019738	CCG	2	6	65341	65346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308429
1108	NC_019738	GAA	2	6	65450	65455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1109	NC_019738	ACCC	2	8	65480	65487	25 %	0 %	0 %	75 %	428308429
1110	NC_019738	ATC	2	6	65496	65501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308429
1111	NC_019738	AAG	2	6	65560	65565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1112	NC_019738	TTG	2	6	65644	65649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308429
1113	NC_019738	GGT	2	6	65741	65746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308429
1114	NC_019738	GTG	2	6	65821	65826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308429
1115	NC_019738	AGA	2	6	65879	65884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308429
1116	NC_019738	CAT	2	6	65965	65970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019738	T	7	7	66034	66040	0 %	100 %	0 %	0 %	428308430
1118	NC_019738	CTG	2	6	66061	66066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308430
1119	NC_019738	C	6	6	66196	66201	0 %	0 %	0 %	100 %	428308430
1120	NC_019738	GAAAA	2	10	66251	66260	80 %	0 %	20 %	0 %	428308430
1121	NC_019738	T	6	6	66262	66267	0 %	100 %	0 %	0 %	428308430
1122	NC_019738	AGG	2	6	66291	66296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308430
1123	NC_019738	CTA	2	6	66362	66367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308430
1124	NC_019738	TAT	2	6	66381	66386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308430
1125	NC_019738	CGA	2	6	66415	66420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308430
1126	NC_019738	CTA	2	6	66435	66440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308430
1127	NC_019738	GATTG	2	10	66450	66459	20 %	40 %	40 %	0 %	428308430
1128	NC_019738	TTA	2	6	66463	66468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308430
1129	NC_019738	GTT	2	6	66543	66548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308430
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1131	NC_019738	GCTT	2	8	66754	66761	0 %	50 %	25 %	25 %	428308431
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1489	NC_019738	A	6	6	88070	88075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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